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2025-05-17 20:12:10甲基化修飾多肽: 甲基化修飾多肽是指多肽分子中某些氨基酸的側鏈基團被甲基基團取代后的產物。這種修飾可以改變多肽的生物活性、穩定性和代謝特性。甲基化修飾多肽在生物醫藥、農業科學等領域具有廣泛應用，如作為藥物候選分子、植物生長調節劑等。它們具有特異性高、活性強等特點，為相關領域的研究和應用提供了新的工具和方法。

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甲基化修飾多肽問答

2022-12-30 09:07:28科學家揭示DNA主動去甲基化相關機制: 在今日《科學》的論文中，André Nussenzweig研究團隊以有絲***后的神經元和巨噬細胞為研究體系，發現DNA主動去甲基化對于增強子激活是必要的，并且解釋了神經元和巨噬細胞增強子上DNA單鏈損傷的來源以及闡述其中的機制。據研究者介紹，在哺乳動物細胞中，5-甲基胞嘧啶（5mC）是***主要的DNA修飾，它對于發育和細胞分化有重要作用。5mC可被TET酶氧化為5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)、5-甲酰基胞嘧啶（5fC）和5-羧基胞嘧啶（5caC），引起DNA去甲基化。在DNA主動去甲基化過程中，5fC和5caC被胸腺嘧啶DNA糖基化酶（TDG）切除產生無堿基位點，并后續產生DNA單鏈損傷。其能通過堿基切除修復（BER）途徑***終修復轉化為C堿基。根據過往研究數據，研究者推測單鏈DNA損傷可能與TET-TDG介導的5fC/5caC切除有關。利用細胞工程獲得的興奮性神經元（iNeuron），研究者降低了細胞TDG水平，結果發現此行為可讓神經元中可以積累大量的5fC/caC。隨后，研究者利用課題組開發的DNA單鏈損傷檢測技術發現，降低TDG水平幾乎消除了DNA單鏈損傷。這也說明，神經元中DNA單鏈損傷來源于TDG依賴的DNA主動去甲基化。▲研究示意圖（圖片來源：Active DNA demethylation damages DNA，DOI: 除了在神經細胞增強子上觀察到重復出現的DNA損傷修復事件，研究者還使用了由前體B細胞轉分化來源的巨噬細胞作為測試對象。通過CRISPR/Cas9敲除TET2和TDG蛋白，研究者也在巨噬細胞中發現了主動去甲基化引起的DNA單鏈損傷和修復過程。不過兩者也有著略微的區別，巨噬細胞偏好使用短補丁堿基切除修復（short-patch BER）以填補單核苷酸斷裂缺口，而神經元會同時使用長補丁堿基切除修復（long-patch BER）和短補丁堿基切除修復。根據論文，TDG缺失不會影響巨噬細胞和神經細胞的分化，卻會在分化過程中讓數千種基因的表達發生變化。這對細胞的行為是有影響的，例如TDG缺失削弱了巨噬細胞吞噬細菌的能力。而TDG被敲除，會部分影響神經元分化成熟相關基因的表達上調，包括神經突觸前信號通路調控的相關基因。研究者指出，新研究發現的機制對于腫瘤治有一定啟示意義。在DNA 主動去甲基化過程中，若使用抗腫瘤胞嘧啶類似物（Ara-C）中斷DNA修復會觸發 TDG 依賴性DNA損傷應答和神經元死亡，這表明神經元在正常分化和分化成熟后內在的生理活動可能會導致化療造成的神經損傷。 André Nussenzweig課題組博士后王東鵬，吳薇（兼共同通訊作者，現為中科院分子細胞科學***創新中心研究員）和研究科學家Elsa Callen為該論文的共同***作者。現階段核酸檢測是分析疾病的重要手段，洛陽吉恩特生物giant-bio自主研發生產的納米核酸提取磁珠（DNA/RNA提取磁珠）磁響應時間迅速，提取效率高，可明顯縮短實驗時間，提高實驗效率，并在提取結果上保持穩定,另外羧基磁珠和氨基磁珠也是制作免疫磁珠的重要原料。

2022-05-06 09:04:16多肽芯片能用在哪里？: 多肽芯片能用在哪里？多肽芯片是一種新型的生物芯片，是研究蛋白質與蛋白質或其他物質（如核酸、多糖、化合物）之間相互作用最直觀的研究技術。多肽芯片在諸多領域中具有廣泛的應用前景，如疫苗開發、藥物研發和篩選、臨床檢測以及蛋白質的基礎功能研究。多肽芯片可用在抗原表位篩選、藥物開發及篩選、臨床檢測等。l 多肽芯片在抗原表位篩選方面體現出巨大的優勢，可大量縮短開發時間，為前期的抗體篩選提供準確的指標和快速的反饋；l 多肽芯片為藥物開發及篩選提供有效的解決平臺，可有效提高新藥研發的成功功率，降低研發失敗的可能性，加快藥物研發進程；l 現代醫療技術顯示，大多數疾病與蛋白質表達異常有關，通過檢測患者樣本中的蛋白活性即可找到其發病機理，多肽芯片技為該難題提供了快捷的方法，使得對癥下藥成為可能。 Aurora提供多肽芯片的制備用到的微陣列點樣設備——多肽芯片點樣儀Aurora多肽芯片點樣儀采用化學固相合成法，可按需制備穩定的多肽微陣列芯片，如新冠病毒原始毒株及其突變體奧密克戎S蛋白、N蛋白的微陣列芯片，更多產品詳情可進一步了解產品價格或技術參數等信息，直接聯系Aurora員。【內容源自Aurorabiomed公眾號《多肽芯片為什么那么火？》，轉載請注明】Aurora集團30年來致力于制造生物醫藥領域自動化高通量設備。

2022-04-29 09:33:56什么是多肽芯片技術？: 什么是多肽芯片？多肽芯片是一種新型的生物芯片，是研究蛋白質與蛋白質或其他物質（如核酸、多糖、化合物）之間相互作用最直觀的研究技術。多肽芯片在諸多領域中具有廣泛的應用前景，如疫苗開發、藥物研發和篩選、臨床檢測以及蛋白質的基礎功能研究。多肽芯片如何制備多肽芯片是將已知的蛋白序列或任意設計的氨基酸序列分解成包含重疊氨基酸的多肽片段，將這些多肽片段按一定次序固定在經特殊處理過的載體基質上，每張芯片包含成千上萬甚至更多的肽鏈。將待測物與芯片反應，經過免疫檢測技術發現與待測物有結合反應的位點/域，經過圖像數據處理與分析，尋找蛋白質/氨基酸與待測物的結合部位。多肽芯片技術及儀器l 多肽芯片技術可高通量點樣，多肽芯片上承載大量的多肽片段，可快速高效的找到相應結合位點/域；l 點樣技術穩定可靠，多肽芯片上固載的多肽片段包含蛋白全序列，相對于原大分子蛋白質而言更穩定，不易分解失活，采集的數據更為準確；l 點樣靈活多樣，多肽片段可不局限于已知的蛋白結構，構成多肽分子的氨基酸可以是進行過化學修飾的非天然氨基酸，在藥物研發和篩選方面具有很強的靈活性；l Aurora多肽芯片點樣儀：Aurora集團30年來致力于制造生物醫藥領域自動化高通量設備。Aurora多肽芯片點樣儀采用化學固相合成法，可按需制備穩定的多肽微陣列芯片，如新冠病毒原始毒株及其突變體奧密克戎S蛋白、N蛋白的微陣列芯片，更多產品詳情可進一步了解產品價格或技術參數等信息【內容源自Aurorabiomed公眾號《多肽芯片為什么那么火？》，轉載請注明】

2022-05-11 09:13:15如何讓多肽芯片制備更高效？: 如何讓多肽芯片制備更高效？多肽芯片的制備原理？多肽芯片是將已知的蛋白序列或任意設計的氨基酸序列分解成包含重疊氨基酸的多肽片段，將這些多肽片段按一定次序固定在經特殊處理過的載體基質上，每張芯片包含成千上萬甚至更多的肽鏈。將待測物與芯片反應，經過免疫檢測技術發現與待測物有結合反應的位點/域，經過圖像數據處理與分析，尋找蛋白質/氨基酸與待測物的結合部位。多肽芯片技術具備高通量，穩定可靠，靈活多樣的特點。多肽芯片上承載大量的多肽片段，可快速、有效的找到相應結合位點/域；多肽芯片上固載的多肽片段包含蛋白全序列，相對于原大分子蛋白質而言更穩定，不易分解失活，采集的數據更為準確；多肽片段可不局限于已知的蛋白結構，構成多肽分子的氨基酸可以是進行過化學修飾的非天然氨基酸，在藥物研發和篩選方面具有很強的靈活性； Aurora多肽芯片點樣儀讓多肽芯片制備更高效！Aurora集團30年來致力于制造生物醫藥領域自動化高通量設備。Aurora多肽芯片點樣儀采用化學固相合成法，可按需制備穩定的多肽微陣列芯片，如新冠病毒原始毒株及其突變體奧密克戎S蛋白、N蛋白的微陣列芯片，更多產品詳情可進一步了解產品價格或技術參數等信息，請發郵件至market@aurorabiomed.com.cn或直接聯系Aurora銷售人員。【內容源自Aurorabiomed公眾號《多肽芯片為什么那么火？》，轉載請注明

2022-11-29 12:00:18【Application Note】受阻、非標準氨基酸的微波輔助多肽固相合成: 摘要?微波增強的多肽固相合成（SPPS）能夠快速有效地進行大體積氨基酸（如Aib和N-Me-A）的常規困難偶聯? 酰基載體蛋白衍生物VQAibAibIDYINGOH和VQ(N-Me-A)(N-Me-A)IDYING-OH的合成在2小時內完成，純度分別為95%和86%? GEQKLGAibAibAibASEESLG-NH2的合成在3小時內完成，純度為 89%介紹在許多生物學相關的化合物中都可以找到受阻的非標準氨基酸，例如α-氨基異丁酸(Aib)和N-甲基丙氨酸((N-Me)-A)（圖1）1-3。然而，包括Aib或N-甲基化氨基酸的肽合成已被證明具有挑戰性；第二個甲基引入的空間位阻，無論是在α-碳還是酰胺氮上，都使這些氨基酸衍生物在傳統SPPS中難以偶聯。圖1 位阻、非標準氨基酸然而，通過使用微波增強的SPPS，與受阻非標準氨基酸相關的困難已被最小化。在SPPS中使用微波能量可以快速有效地完成大體積氨基酸（如Aib和N-甲基丙氨酸）的常規困難偶聯4,5。材料和方法試劑N-α-Fmoc-α-氨基異丁酸獲自AnaSpec(Freemont,CA)。Fmoc-N-Me-Ala-OH獲自Peptides International(Louisville,KY)。所有其他氨基酸均獲自CEM Corporation(Matthews,NC)，并含有以下側鏈保護基團：Asn(Trt)、Asp(OMpe)、Gln(Trt)、Glu(OtBu)、Lys(Boc)、Ser(OtBu) 和Tyr(tBu) 。Oxyma Pure和Rink Amide ProTideTM LL樹脂購自CEM Corporation(Matthews,NC)。N,N-二異丙基碳二亞胺(DIC)獲自CreoSalus(Louisville,KY)。Fmoc-Gly-Wang Resin LL購自NovaBiochem(St.Louis,MO)。哌啶獲自Alfa Aesar(Ward Hill,MA)。三氟乙酸(TFA)、3,6-dioxa-1,8-octanedithiol(DODT)、三異丙基硅烷(TIS)和乙酸購自Sigma-Aldrich(St.Louis,MO)。二氯甲烷(DCM)、N,N-二甲基甲酰胺(DMF)和無水乙醚(Et2O)購自VWR (West Chester,PA)。HPLC級水(H2O)和HPLC級乙腈(MeCN) 購自 Fisher Scientific (Waltham, MA) 。多肽合成：GEQKLGAibAibAibASEESLG-NH2使用CEM Liberty Blue?自動微波肽合成儀在Rink Amide ProTide LL樹脂（離子交換容量：0.18meq/g）上以0.1mmol規模制備多肽。用哌啶和Oxyma Pure在DMF中進行脫保護。使用DMF中的DIC、DMF中的Oxyma Pure和5倍過量的Fmoc-AA-OH進行偶聯反應。使用具有TFA/H2O/TIS/DODT的CEM Razor高通量肽切割系統進行切割。裂解后，肽在無水乙醚中沉淀并凍干過夜。多肽合成：VQAibAibIDYING-OH使用CEM Liberty Blue自動微波肽合成儀在FmocGly-Wang LL 樹脂（離子交換容量：0.33meq/g）上以0.1mmol規模制備。用哌啶和Oxyma Pure在DMF中進行脫保護。使用DMF中的DIC、DMF中的Oxyma Pure和5倍過量的Fmoc-AA-OH進行偶聯反應。使用具有 TFA/H2O/TIS/DODT的CEM Razor高通量肽切割系統進行切割。裂解后，肽在無水乙醚中沉淀并凍干過夜。多肽合成：VQ(N-Me-A)(N-Me-A)IDYING-OH使用CEM Liberty Blue自動微波肽合成儀在FmocGly-Wang LL 樹脂（離子交換容量：0.19meq/g）上以0.1mmol規模制備肽。用哌啶和Oxyma Pure在DMF中進行脫保護。使用DMF中的DIC、DMF中的Oxyma Pure和5倍過量的Fmoc-AA-OH進行偶聯反應。使用具有 TFA/H2O/TIS/DODT的CEM Razor高通量肽切割系統進行切割。裂解后，肽在無水乙醚中沉淀并凍干過夜。多肽分析在配備有PDA檢測器的Waters Acquity UPLC系統上分析肽，該檢測器配備Acquity UPLC BEH C8柱（1.7mm和2.1x100mm）。UPLC系統連接到Waters 3100 Single Quad MS用于結構測定。在Waters MassLynx軟件上進行峰分析。使用(i)H2O和(ii)MeCN中的0.1%TFA梯度洗脫進行分離。結果在Liberty Blue自動微波肽合成儀上GEQKLGAibAibAibAibASEEDLG-NH2的微波增強SPPS產生了89%純度的目標肽（圖2）。圖2.GEQKLGAibAibAibASEEDLG-NH2的HPLC色譜圖在Liberty Blue自動微波肽合成儀上的VQAibAibIDYING-OH的微波增強SPPS產生了純度為95% 的目標肽（圖3）。圖 3：VQAibAibIDYING-OH的HPLC色譜圖在Liberty Blue自動微波肽合成儀上的VQ(N-Me-A)(N-Me-A)IDYING-OH的微波增強SPPS產生了純度為86%的目標肽（圖4）。圖 4：VQ(N-Me-A)(N-Me-A)IDYING-OH的HPLC色譜圖結論微波增強的SPPS能夠快速有效的進行大體積氨基酸（如Aib和N-Me-A）的常規困難偶聯。常規合成GEQKLGAibAibAibASEEDLG-NH2需要40小時且純度< 10%，但微波增強SPPS在3小時內產生目標肽且純度為89%。此外，酰基載體蛋白衍生物VQAibAibIDYING-OH和VQ(N-Me-A)(N-Me-A)IDYING-OH的合成在2小時內完成，純度分別為95% 和86%。微波增強的SPPS已被證明是一種有效的工具，可以最大限度地減少SPPS中受阻的非標準氨基酸相關的困難。參考文獻Mueller, P.; Rudin, D. O. Nature. 1968, 217, 713–719.Rebuffat, S.; Goulard, C.; Hlimi, S.; Bodo, B. J. Pept. Sci. 2000, 6, 519–533.Ahmed, G.; Elger, W.; Meece, F.; Nair, H. B.; Schneider, B.; Wyrwa, R.; Nickisch, K. Bioorg. Med. Chem. 2017, 25, 5569–5575. Collins, J. M. Microwave-Enhanced Synthesis of Peptides, Proteins, and Peptidomimetics. In Microwaves in Organic Synthesis, Third Edition; de la Hoz, A.; Loupy, A.; Wiley-VCH: Weinheim, 2012; 897–959.Ben Haj Salah, K.; Inguimbert, N. Org. Lett. 2014, 16 (6), 1783–1785.