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2025-04-25 14:12:23程序編輯
程序編輯是指使用特定的編程語言或工具,根據需求和設計規格,編寫、修改和調試程序代碼的過程。它涉及理解問題、規劃解決方案、編寫清晰且高效的代碼、測試程序以確保其正確性和性能,并根據反饋進行必要的調整。程序編輯是軟件開發的核心環節,要求編程者具備良好的邏輯思維、問題解決能力和對所用編程語言的深入理解。通過程序編輯,開發者能將抽象的算法和數據結構轉化為可執行的計算機程序。

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2022-05-19 09:29:54科學家開發重量級基因編輯工具
一篇在線發表于《細胞》雜志的論文介紹了一項重要突破:來自韓國的研究團隊***在線粒體DNA中實現A堿基到G堿基的轉換,為基因編輯技術填補上一塊***關重要的拼圖,也帶來了治愈多種線粒體遺傳病的希望。從上世紀60年代***發現***性內切酶,到1985年發明PCR技術,再到***近十年CRISPR技術誕生、用于活體生物的基因編輯,短短半個世紀,人類在一次又一次的突破中實現了操縱DNA能力的巨大飛躍。其中,CRISPR的出現更是讓科學家能高效編輯基因組中的致病突變,為眾多遺傳病提供全新的方案。不過,還有一朵烏云長期籠罩在基因編輯領域的上空,這就是線粒體DNA的編輯。作為參與能量代謝的重要細胞器,線粒體中也含有少量來自母系的DNA。如果這部分基因發生突變,則可能導致多種與代謝相關的遺傳疾病。例如,Leber遺傳性視神經病變(LHON)可能導致患者失明,這種兇險的疾病就是由線粒體DNA的點突變導致的。線粒體DNA突變還可能導致某些線粒體腦肌病,患者的大腦遭受損傷,可能出現癲癇、精神行為異常等癥狀。平均每5000個人里,就有一個人患上線粒體點突變導致的遺傳病。盡管基因編輯工具***近十年迎來爆發式發展,但面對線粒體遺傳病時,這些工具卻總是難以奏效。例如,當下***為盛行的CRISPR-Cas系統就因為向導RNA不能穿越線粒體膜,因而無法用于線粒體疾病。線粒體DNA的編輯,可以說是基因編輯領域***后一塊未經涉足的土地,而這個難題也成為治愈多種遺傳疾病必須跨越的障礙。2020年,一項***性的突破到來。Broad研究所的劉如謙教授團隊開發了一款名為DdCBE的基因編輯工具,可以直接修改雙鏈DNA上的堿基,實現從C堿基到T堿基的轉換,這也是科學家***在人體細胞中進行線粒體DNA的編輯。不過,作為線粒體DNA編輯的開拓性成果,DaCBE也有不足之處:其只能高效地進行TC-TT序列的轉換,在90個已知的致病線粒體突變位點中,只有9個能得到修復。而在這90個突變位點中,有多達39個都可以通過A-G堿基的轉換來修復。如果能找到實現A-G轉換的手段,那么包括上述兩種疾病在內,多種線粒體遺傳病都有望迎來治愈的方法。在這項發表于《細胞》的***新研究中,來自韓國基礎科學研究所基因編輯中心的研究團隊終于完成了這項“不可能的任務”,他們開發出一款全新的基因編輯平臺,命名為轉錄激活因子樣效應物相關脫氫酶(transcription activator-like effector-linked deaminases,簡稱TALED)。▲TALED編輯線粒體DNA的示意圖論文***作者CHO Sung-Ik表示:“我們設計的新型堿基編輯器極大地拓展了線粒體DNA編輯的范圍,這不僅有助于構建疾病模型,還將幫助人們開發新療法。”TALED到底是什么?接下來我們將看到,TALED由3個功能各異的主要部分組成,它們環環相扣、共同協作,***終完成這項基因編輯任務。***個部分,可以看作TALED的向導。前面說到,常見的基因編輯系統無法進入線粒體。為了解決這個問題,TALED與劉如謙團隊開發的DaCBE一樣,使用了轉錄激活因子樣效應物(TALE)。作為一種DNA結合蛋白,TALE蛋白能夠靶向特異的DNA序列,其在線粒體靶向序列(MTS)的引導下進入線粒體,并且與特定的線粒體DNA序列結合。到這里,TALED就被帶到了工作場所。在這里,輪到TALED的第二個部分登場。研究團隊需要找到合適的脫氫酶,在這里實現A-G堿基的轉換。為此,他們選擇是名為TadA8e的腺嘌呤脫氫酶,其由大腸桿菌的腺嘌呤脫氫酶改造而來。這個選擇頗具創意,因為TadA8e被認為是一種專門對單鏈DNA起作用的蛋白,但在這里,它需要在線粒體的雙鏈DNA中進行堿基編輯。這篇論文的通訊作者,基因編輯中心主任KIM Jin-Soo教授說:“沒有人想過用TadA8e在線粒體中進行堿基編輯,因為它被認為只對單鏈DNA起作用。正是這個跳出傳統框架的想法,幫助我們發明了TALED。”而幫助TadA8e做到這一點的,是TALED的***后一個主要部分:胞嘧啶脫氫酶DddAtox。DddAtox使得雙鏈DNA可以短暫地解開,而TadA8e正是抓住了這個轉瞬即逝的時間窗口,在人類細胞的線粒體中高效催化A-G堿基的轉換,編輯頻率可高達49%。▲TALED實現了A-G堿基的轉換通過對TALED的調整,研究團隊分別開發出能同時實現A-G以及C-T堿基轉換的技術,以及僅進行A-G轉換的技術。當然,作為一項開創性的技術,TALED仍有不***之處,例如在進行堿基編輯時,可能會造成與目標位點相鄰的核苷酸也發生轉換;此外,TALED是否會在哺乳動物細胞中產生脫靶效應也有待觀察。但毫無疑問,TALED技術的出現讓我們又多了一種***潛力的基因編輯工具,展望這項技術的未來應用場景,研究團隊希望能提升TALED的編輯效率與特異性,***終能夠分別在胚胎、新生兒與成年患者體內修正致病的線粒體突變。我們期待,那些受困于線粒體遺傳病的人們終將迎來治愈的一刻。RNA提取磁珠屬于納米生物磁珠的一種,主要作用是用于核酸提取過程中的RNA提取,粒徑分布在500nm左右,是洛陽吉恩特生物自主研發生產的高分子納米磁性微球,該磁珠懸浮時間長,磁響應時間迅速,對DNA甲基化過程中的提取環節提供良好的支持,可明顯縮短實驗時間,提高實驗效率,并在提取結果上保持穩定,配合核酸提取儀,更能實現快速的RNA提取。
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2023-10-13 15:12:24檢測標準查新、確認、驗證程序
1.1 按照《實驗室資質認定評審準則》第5.3.2款的要求,為及時、有效地獲得最新標準,以確保實驗室在最短的時間內維持使用標準的最新有效版本,需定期進行標準查新。 1.2 對查新的標準進行確認和驗證是為了證明實驗室是否能夠達到方法需要的操作水平,也就是說,要辨別新、舊標準內容是否存在差異,從人員資質能力、儀器設備配置、操作方法、試劑材料、環境設施條件等方面進行分析,并建立確認記錄,以提供能夠使用該方法的客觀依據。如果新標準與舊標準不僅僅是文字上的修改而涉及到技術指標、儀器設備、操作方法等的變更,實驗室應該在確認時進行試驗驗證并記錄。
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2023-06-16 11:53:01【Leica in Scope課程】術中OCT:基因治療程序的專家見解
第三期:術中OCT:基因治 療程序的專家見解課程簡介:來自英國倫敦摩菲眼科醫院和大奧蒙德街兒童醫院的 Robert Henderson 醫師和來自比利時根特大學醫院的Fanny Nerinckx 博士將解釋術中OCT如何支持基因治 療程序以及它如何為外科醫生提供有價值的信息。他們將各自分享他們實踐中的臨床案例。講者:Mr. Robert Henderson高級眼科顧問醫師倫敦摩菲眼科醫院和大奧蒙德街兒童醫院英國Dr. Fanny Nerinckx前后節眼科醫師根特大學醫院   比利時
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2021-11-22 14:35:08? 數字PCR|德國漢堡大學基于單細胞基因編輯低頻脫靶新方法
CRISPR-Cas9技術徹底改變了基礎生物研究和應用生物技術的許多領域。但在臨床基因治療實施中脫靶效應的檢測仍然存在難題。德國漢堡大學-艾本多夫醫學中心(UKE)干細胞移植、細胞和基因治療研究所的學者們近日在知名雜志《Molecular Therapy》上發表“LATE–a novel sensitive cell-based assay for the study of CRISPR/Cas9-related long-term adverse treatment effects”的文章,建立了稱為LATE(長期不良治療效果鑒定檢測)的新型檢測方法,該方法使用Stilla naica?微滴芯片數字PCR系統檢測低頻的脫靶事件,且有助于分析Cas9脫靶切割效應的影響,并可在單細胞層面進行評估。為了證明LATE方法有助于檢測Cas9脫靶切割后的功能影響,研究人員進行了小規模的原理驗證實驗:明星基因TP53基因敲除后會導致細胞表現出相對生長優勢,這是主要的致瘤性標志之一,因此可以作為驗證“LATE”檢測脫靶能力的指示。本文選取TP53進行CRISPR靶向實驗,并轉染到有限稀釋后的原代人類新生兒包皮成纖維NUFF細胞中,通過“LATE”方法重復檢測到低頻(
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2022-04-22 11:27:24實驗Tips丨滅菌程序你選對了嗎?
滅菌程序你選對了嗎?需要大量培養樣品時,滅菌是實驗里不可缺少的環節。TOMY滅菌鍋為客戶提供了多種可以選擇的程序,怎么選才能更好地提升實驗效率呢?還有意想不到的功能等著你~液體滅菌過程以常用的LB培養基為例,在藍蓋瓶中倒入配置好、調好pH的培養基后,我們需要選擇液體滅菌功能,通常液體滅菌所花費的時間更長。因為我們將液體滅菌時的排氣、制冷速度設為0,為什么要這樣設置呢?不知道有沒有小伙伴遇到過這樣的情況:急用培養基,但是從剛滅菌鍋里拿出來溫度太高無法使用,就把藍蓋瓶放進冷水里試圖降溫。此時此刻,只聽見“啪”的一聲,這一瓶培養基算是報廢了,還損失了一個瓶子。這種現象叫做暴沸,因此在液體滅菌時我們要避免溫度驟然下降。正常滅菌過程當滅菌的物品主要是固體,如藍蓋瓶、錐形瓶、培養皿、涂布棒和槍頭等,此時我們可以選擇正常滅菌過程,排氣速度和降溫速度都會比液體滅菌要快很多。滅菌保溫過程這個功能對于滅菌后沒有時間及時取出的小伙伴非常友好。加了瓊脂的培養基,在滅菌完成后后可以放在TOMY滅菌鍋里保溫。(長按FUNCTION可以手動按需調節保溫時間)加熱保溫過程烘箱放滿了怎么辦?TOMY滅菌鍋的這個功能可能很少有人知道,可以將培養基溶解并保溫。在此方案下,滅菌鍋將會先加熱溶解培養基,然后進入保溫程序。(長按FUNCTION可以手動按需調節保溫時間)正確地選擇滅菌程序~提高實驗效率的同時也是對儀器的養護~
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